科學小飛俠包括了五位年輕的成員,各自代號分別是:白鳥一號、飛鷹二號、天鵝三號、黑燕四號和貓頭鷹五號,除了五號阿龍外,其餘每個人都有自己的座機與自己的隨身武器,因為阿龍必須要留守鳳凰號。
五個成員手上都有一個電子錶,他們可以使出「火鳥功」來變身,當五個人結合在一起時,可以使出「龍捲風」,鳳凰號上有兩個武器,一是「火鳥飛彈」,另一是「火鳥功」,這時鳳凰號會變成一隻火鳥,翱翔天際並且發出三千度的高溫,不過這兩個武器必須要五人到齊才能使用。
惡魔黨的首領老是想要毀滅地球,他的手下皮爾是惡魔黨的大頭目,皮爾是一個智慧非常優越的陰陽人,常稱科學小飛俠為傻鳥。
故事的結局是:惡魔黨在喜馬拉雅山建造基地,在那裡挖掘地心通道,並且使用核子彈爆破地心,科學小飛俠雖然摧毀了那個基地,但卻停不了那個:爆破地心的機器,科學小飛俠束手無策之時,就在倒數0002秒之際,機器終於停了。
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